44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0183 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  100 
 
 
161 aa  309  9e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  98.5 
 
 
133 aa  251  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  36.07 
 
 
127 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  37.08 
 
 
131 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  37.08 
 
 
131 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  35.25 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  35.25 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  35.25 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  35.25 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  35.25 
 
 
127 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  34.43 
 
 
127 aa  57.8  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  32.26 
 
 
129 aa  57.4  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  34.43 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  34.43 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  34.43 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  33.61 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  33.61 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  36.19 
 
 
135 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  33.33 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  27.4 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  33.87 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  33.06 
 
 
134 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  33.67 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  34 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  34.48 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  32.67 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  36.17 
 
 
126 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  35.11 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  28.33 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  33.68 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  34.74 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  32.32 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  32.61 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  33.68 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  34.74 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  33.68 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  28.69 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  33.68 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  28.57 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  27.87 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  27.87 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  32.35 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  36.17 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>