50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5438 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 		 135 aa  264  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  99.26 
 
 		 135 aa  263  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  99.26 
 
 		 135 aa  262  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  98.52 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  82.96 
 
 		 135 aa  224  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  80.74 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  80 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  67.69 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  67.69 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  60.44 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  43.08 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  54.72 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  46.39 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  46.39 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  40.34 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  40.34 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  43.33 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  39.83 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  39.5 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  39.5 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  39.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  39.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  39.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  40.34 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  38.66 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  38.66 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  38.66 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  36.13 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  37.82 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  43.48 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  36.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  40 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  38.32 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  35.92 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  42.53 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  42.22 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  38.46 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  45.31 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  42.39 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  40.48 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  41.3 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  40.22 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0186  hypothetical protein  40.32 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0195864  hitchhiker  0.002025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  30.59 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  34.74 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  34.74 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  34.02 
 
 		 176 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>