61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3312 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  100 
 
 		 125 aa  243  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  51.81 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  42.86 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  41.9 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  40 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  40.95 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  40.95 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  35.58 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  39.05 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.96 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.96 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.96 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  36.19 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  35.51 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  45.57 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  33.65 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  41.75 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  46.58 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  38.04 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  38.04 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  32.71 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  38.82 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  38.82 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  33.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  36.49 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  41.1 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  33.66 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  34.48 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  38.03 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.14 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.14 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.14 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.14 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.14 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.14 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  32.61 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  35.29 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  35.29 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  39.18 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  36.47 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  41.38 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  30.34 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  30.34 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  30.34 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  30.34 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  30.48 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  30.48 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  35.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  35.71 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.71 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  37.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  35.09 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  28.72 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  36.14 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>