53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2437 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  54.47 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  45.24 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  35.87 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  35.96 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  33.04 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  36.52 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  32.46 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  34.21 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  35.37 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  32.46 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  34.69 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  29.84 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  31.58 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  31.58 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  31.58 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  31.58 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  41.57 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  33.67 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  30.7 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  30.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  30.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  30.7 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  32.46 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  34.65 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  35.44 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  35.8 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  30.1 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  37.35 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  38.46 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  38.46 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  37.08 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  38.2 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  38.2 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.96 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  35.96 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  38.2 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  36.79 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  40.32 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  34.57 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.79 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  40.32 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  30.5 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  40.48 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  33.91 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  34.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  39.29 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  34.52 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2172  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  1.90327e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>