60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3901 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  96.13 
 
 		 181 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  85.08 
 
 		 181 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  68.72 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  69.89 
 
 		 175 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  69.32 
 
 		 174 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  67.05 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  67.05 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  66.48 
 
 		 174 aa  236  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  66.48 
 
 		 174 aa  236  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  64.77 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  76.47 
 
 		 118 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  44.94 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  38.76 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  39.24 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  37.08 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  36.52 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  36.36 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  35.4 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  30.12 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  35.44 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  35.44 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  32.64 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  31.97 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  36.14 
 
 		 123 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  34.17 
 
 		 127 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  27.85 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  34.96 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  35.83 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  34.17 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  40.79 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  38.67 
 
 		 129 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  31.09 
 
 		 127 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  35.29 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  41.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  36.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  36.14 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  32.5 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  32.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  40 
 
 		 129 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  24.58 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  31.67 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  26.76 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  27.73 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  35.53 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  28.35 
 
 		 133 aa  42  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  35.04 
 
 		 126 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  35.04 
 
 		 126 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>