44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04090 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  40.5 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  36.72 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  40.34 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  38.94 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  34.65 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  34.43 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  34.68 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  34.68 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  34.65 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  44.71 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  34.68 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  35.48 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  33.87 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  35 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  40.62 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  43.53 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  42.35 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  39.47 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  42.35 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  37 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  39.62 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  36 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  29.77 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  29.77 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  30.63 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  29.63 
 
 		 161 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  42.03 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  42.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  33.96 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  38.27 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  36.7 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06111  hypothetical protein  32.73 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  31.18 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  34.48 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  34.48 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  40 
 
 		 135 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>