42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4183 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 		 127 aa  246  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 		 127 aa  246  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  99.21 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  84.25 
 
 		 127 aa  213  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  70.08 
 
 		 127 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  70.08 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  59.84 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  63.78 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  56.45 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  54.84 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4153  ATP synthase F0, I subunit  59.72 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000580419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4107  ATP synthase F0, I subunit  61.43 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000123417  normal  0.0706174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5175  ATP synthase F0, I subunit  61.43 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000733243  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  42.73 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  36.67 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  41.94 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  38.46 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  34.75 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  36.36 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  39.18 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.36 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  37.36 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  36.26 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.36 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  36.26 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.36 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  36.26 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  37.36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  39.18 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  37.65 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  40 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  36.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  35.16 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  32.71 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1703  F0F1 ATP synthase subunit I  27.93 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.666205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  34.48 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>