48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4228 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  82.54 
 
 
126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5175  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000733243  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4107  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000123417  normal  0.0706174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  59.68 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  54.4 
 
 
127 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  54.4 
 
 
127 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  53.6 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  57.26 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  56.91 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4153  ATP synthase F0, I subunit  97.33 
 
 
75 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000580419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  54.03 
 
 
127 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  35.25 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  37.72 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  38.94 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  36.36 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  37.7 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  35.34 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  36.21 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  34.58 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  36.21 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  35.34 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  35.34 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  35.09 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  35.04 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  36.28 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  36.28 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  36.28 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  34.51 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  36.28 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  35.4 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4203  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 
41 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137943  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4082  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 
41 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136612  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4097  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 
41 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  34.58 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  35.54 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  30.43 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4262  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 
41 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0815185  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  30.95 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  30.95 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  31.58 
 
 
135 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>