53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4302 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  40.5 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  36.84 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  37.72 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  36.97 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  40.35 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  29.81 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  29.81 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  33.61 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  32.77 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  32.26 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  32.77 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  37.4 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  34.21 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  32.77 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  31.09 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  30.25 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  31.93 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  37.23 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  32.32 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  31.62 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  35.42 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  40.48 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  40.48 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  40.48 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  34.74 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  37.65 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  39.29 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  30.36 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  26.27 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  32.61 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  39.13 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  33.64 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  35.71 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  35.71 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  25.42 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  32.71 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  32.71 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  32.71 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  24.58 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  37.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  33.64 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  32.84 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  33.02 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  26.09 
 
 		 179 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>