20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2031 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  97.73 
 
 		 132 aa  256  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0186  hypothetical protein  40.4 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0195864  hitchhiker  0.002025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  35.16 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  34.07 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  35.29 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  36.59 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  44.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  32.95 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  32.95 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  34.12 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  37.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  37.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  37.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  37.97 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  32.95 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  31.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>