19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2334 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  97.73 
 
 		 140 aa  256  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0186  hypothetical protein  41.48 
 
 		 155 aa  105  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0195864  hitchhiker  0.002025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  35.16 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  34.07 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  34.31 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  36.59 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  44.83 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  34.12 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  31.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  31.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  36.71 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  36.71 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  36.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  36.71 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  32.95 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>