44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4614 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 
129 aa  248  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  69.66 
 
 
95 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  50.4 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  53.23 
 
 
135 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  53.23 
 
 
135 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  53.23 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  53.23 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  56.41 
 
 
126 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  55.56 
 
 
126 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  51.59 
 
 
135 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  50.79 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  41.59 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  47.3 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  42.68 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  34.19 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  35.04 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  35.04 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  35.04 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  40.21 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  35.04 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  37.61 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  41.58 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  40.54 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  34.19 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  39.67 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  40.54 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  32.48 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  36.75 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  34.19 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  32.48 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  37.5 
 
 
127 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  32.48 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  32.48 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  34.51 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  36.54 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  44.93 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  34.19 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0186  hypothetical protein  28.89 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0195864  hitchhiker  0.002025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  43.37 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  35.92 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  35.16 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  35.16 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>