55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3882 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  100 
 
 
135 aa  268  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  44.87 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  44.87 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  39.22 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  39.22 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  40.43 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  34.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  34.33 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  35.65 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  39.39 
 
 
129 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  31.68 
 
 
134 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  28.8 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  40.74 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  40.91 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  38.46 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  39.39 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  39.39 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  39.39 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  29.91 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  37.66 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  30.38 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  37.88 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  37.88 
 
 
129 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  38.96 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  37.88 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  34.88 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.88 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  34.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.88 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.88 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  30.11 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  34.57 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  28.09 
 
 
128 aa  43.9  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  45.83 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  38.46 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  30.11 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  35.94 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  39.74 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  37.88 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  36.36 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0303  ATP synthase protein I  29.63 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00058209  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  34.86 
 
 
183 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  32.94 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>