16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0186 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0195864  hitchhiker  0.002025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  40.4 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  41.48 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  32.18 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  37.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  37.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  37.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  37.18 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  35.21 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  38.03 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  38.03 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  38.1 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  38.1 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  35.71 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  34.78 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>