32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0473 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  100 
 
 
166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  54.55 
 
 
156 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  57.41 
 
 
162 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  57.41 
 
 
162 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  51.25 
 
 
183 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  57.96 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  44.94 
 
 
159 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  43.29 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  47.65 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  43.59 
 
 
168 aa  94  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  45 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  34.19 
 
 
176 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  31.85 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  34.62 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  37.14 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.67 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  38.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.26 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.26 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  30 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  29.03 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  28.23 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  30.41 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>