25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0320 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  100 
 
 
173 aa  341  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  62.5 
 
 
161 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  64.14 
 
 
183 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  53.64 
 
 
159 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  56.72 
 
 
156 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  53.42 
 
 
164 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  56.12 
 
 
162 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  56.12 
 
 
162 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  50.62 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  51.97 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  47.65 
 
 
166 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  33.13 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  30.3 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  30.32 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  30.12 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  28.83 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.34 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.34 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  32.69 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  30.67 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30.13 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  29.34 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  29.49 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  29.49 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  33.33 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>