50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3501 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  100 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  68.89 
 
 		 172 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  41.62 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  41.11 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  40 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  42.13 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  43.26 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  48.09 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  41.24 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  41.48 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  41.48 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  49.73 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  40.91 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  39.89 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  39.89 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  47.54 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  47.86 
 
 		 118 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  34.36 
 
 		 164 aa  84.7  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  33.55 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  44.25 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  34.81 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  32.95 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  30.41 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  30.41 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  37.38 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  37.38 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  34.44 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  31.87 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  30.61 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  27.83 
 
 		 128 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  30.72 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  31 
 
 		 125 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  31.75 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  35.59 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  34.41 
 
 		 123 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  29.01 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  32.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  31.15 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  33.9 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  31.53 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  29.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  31.15 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  27.59 
 
 		 151 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  38.16 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  30 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>