25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4877 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  100 
 
 		 161 aa  320  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  62.5 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  52.83 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  54.49 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  54.49 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  54.61 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  53.75 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  48.98 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  45.51 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  50 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  43.29 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  32.48 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  29.22 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  23.97 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  26.76 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  31.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  29.53 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  27.52 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  28.86 
 
 		 174 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  27.78 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  26.76 
 
 		 181 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30.13 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  29.03 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  30 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>