22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4107 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  36.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  36.54 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  35.19 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  35.19 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  35.19 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  32.76 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  33.65 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  32.41 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  31.73 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  32.69 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  31.19 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  30.77 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  33.02 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  32.63 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  31.48 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  32.61 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>