53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1633 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1633  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1627  hypothetical protein  98.99 
 
 
198 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.38 
 
 
500 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  31.73 
 
 
412 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1488  hypothetical protein  23.17 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 
402 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
410 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  25.56 
 
 
403 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  25.56 
 
 
403 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  25.56 
 
 
403 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24 
 
 
396 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  23.97 
 
 
444 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.22 
 
 
515 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  26.63 
 
 
460 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  19.85 
 
 
453 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  26.23 
 
 
481 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.89 
 
 
474 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  26.63 
 
 
460 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  26.63 
 
 
460 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.77 
 
 
457 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5121  hypothetical protein  22.65 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.771196  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0200  hypothetical protein  23.76 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  36.76 
 
 
471 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 
587 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.5 
 
 
407 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0224  hypothetical protein  23.76 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 
482 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  32.26 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  22.47 
 
 
466 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0200  hypothetical protein  22.65 
 
 
177 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.16 
 
 
395 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.77 
 
 
452 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  24.14 
 
 
503 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  21.3 
 
 
387 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0204  hypothetical protein  22.1 
 
 
177 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  21.3 
 
 
387 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.42 
 
 
443 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  21.3 
 
 
387 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0171  membrane transport protein; multidrug resistance protein  22.65 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  22.22 
 
 
493 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  21.3 
 
 
387 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  24.06 
 
 
466 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0181  hypothetical protein  22.65 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0179  hypothetical protein  22.65 
 
 
177 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
480 aa  41.6  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
462 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  20.37 
 
 
387 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  19.44 
 
 
381 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.22 
 
 
406 aa  41.2  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  20.37 
 
 
387 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.71 
 
 
453 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  20.37 
 
 
387 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  20.37 
 
 
387 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>