63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1488 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 396 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 464 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1627  hypothetical protein  23.17 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1633  hypothetical protein  23.17 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 464 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 462 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 454 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 394 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 464 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 464 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 458 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 455 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  26.35 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 397 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  23.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 472 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 437 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 462 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 464 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.21 
 
 		 474 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  44.7  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 426 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 399 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 441 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 464 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  25.77 
 
 		 465 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 455 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 442 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1527  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 407 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 391 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  25.69 
 
 		 439 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 442 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 455 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 455 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  25 
 
 		 455 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 407 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 443 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  25 
 
 		 455 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  30.28 
 
 		 418 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 454 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 405 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 419 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  24.59 
 
 		 458 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  24.21 
 
 		 454 aa  41.2  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>