More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2557 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2557  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0967265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2349  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  87.06 
 
 
290 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0181385  hitchhiker  0.00000600969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.71 
 
 
292 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1190  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  78.67 
 
 
294 aa  477  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2410  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  79.3 
 
 
290 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.140851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0055  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  77.89 
 
 
290 aa  454  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0829752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2688  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  74.91 
 
 
287 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0596  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  76.14 
 
 
291 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.82 
 
 
289 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.092975  normal  0.141997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  74.22 
 
 
287 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0423586  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.73 
 
 
291 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0436  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.73 
 
 
287 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0446  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.73 
 
 
287 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.38 
 
 
287 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0590699  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10339  alpha-D-glucose-1-phosphate thymidylyltransferase rmlA  71.08 
 
 
288 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0285  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.13 
 
 
287 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00700603  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02720  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.58 
 
 
307 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.81 
 
 
289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.88 
 
 
289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0331  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 
291 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.284071  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 
286 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.62 
 
 
288 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.02 
 
 
286 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4306  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 
290 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1779  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.69 
 
 
293 aa  381  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149846  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
288 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.61 
 
 
289 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.61 
 
 
289 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.69 
 
 
312 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  63.64 
 
 
310 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 
294 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.55 
 
 
301 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
292 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.62 
 
 
294 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
293 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
292 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  61.75 
 
 
292 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
305 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
292 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 
293 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
291 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  60.84 
 
 
304 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
293 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  63.51 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
296 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
294 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
310 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
293 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1619  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
295 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
296 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 
293 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  367  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
294 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
294 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
294 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.84 
 
 
296 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.94 
 
 
294 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
295 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
293 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
312 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4427  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
294 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
289 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
287 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
294 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
290 aa  364  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
298 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
293 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
288 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 
293 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.84 
 
 
293 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
305 aa  364  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
296 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4445  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
294 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
295 aa  363  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
292 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.180776  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
292 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
296 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
292 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
289 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.93 
 
 
286 aa  362  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
293 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  59.38 
 
 
295 aa  362  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>