More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4723 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
314 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.35 
 
 
314 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.363424  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.07 
 
 
314 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.02 
 
 
314 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.7 
 
 
314 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
313 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
313 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.23 
 
 
313 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
308 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
313 aa  244  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  42.44 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  41.61 
 
 
313 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
309 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
308 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  40.36 
 
 
339 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
313 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
313 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
314 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  47.4 
 
 
311 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.81 
 
 
315 aa  235  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  40.36 
 
 
336 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.07 
 
 
333 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
315 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.44 
 
 
313 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
313 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.94 
 
 
337 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  39.23 
 
 
306 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  39.23 
 
 
306 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
313 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
306 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  39.23 
 
 
306 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
316 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
306 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  40.36 
 
 
336 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.56 
 
 
313 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
313 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.76 
 
 
336 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
320 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
311 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
317 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
306 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.58 
 
 
314 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.36 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
306 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  42.95 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.77 
 
 
313 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
306 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
306 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  43.88 
 
 
298 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
336 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
311 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.63 
 
 
306 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
306 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.63 
 
 
306 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  42.77 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
313 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  42.77 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.55 
 
 
314 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  42.77 
 
 
306 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  42.77 
 
 
306 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
333 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
306 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 
306 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
336 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
306 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
336 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
336 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.36 
 
 
336 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.24 
 
 
359 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
313 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  41.16 
 
 
307 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  40.66 
 
 
336 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
318 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
332 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.06 
 
 
336 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  43.41 
 
 
327 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
312 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
315 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  43.41 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>