45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6163 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  100 
 
 		 189 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  76.76 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  68.29 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  68.29 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  73.72 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  75 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  64.81 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  75 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  64.81 
 
 		 178 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  66.04 
 
 		 175 aa  220  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  65.13 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  68.31 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  68.31 
 
 		 169 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  61.64 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  57.75 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  41.04 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  49.26 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  48.89 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  42.96 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  42.34 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  37.68 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  36.42 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  37.5 
 
 		 438 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  32.91 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  33.73 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  37.04 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  35.17 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  31.49 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  29.35 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  34.78 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  31.18 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  30.81 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  35.82 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  34.31 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  32.33 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  30.6 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  27.11 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  27.48 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  26.52 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  27.6 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  27.09 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  27.59 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>