38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2201 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  48.21 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  50.65 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  43.01 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  45.96 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  41.13 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  31.52 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  37.68 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  37.31 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  33.81 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  31.48 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  35.67 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  35.67 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  38.06 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  31.18 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  36.09 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  35.82 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  34.81 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  32.14 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  36.3 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  37.31 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  34.31 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  33.08 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  34.53 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  31.69 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  33.08 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  32.12 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  29.86 
 
 		 438 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  27.13 
 
 		 314 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  26.95 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  27.93 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  28.86 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  33.02 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  30.94 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  38.6 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>