51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2394 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  100 
 
 		 158 aa  327  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  44.79 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  38.06 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  40 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  31.48 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  34.39 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  37.86 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  34.78 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  34.31 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  32.54 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  34.51 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  35.51 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  33.8 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  34.51 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  31.95 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  32.87 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  31.16 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  31.16 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  31.37 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  30 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  29.66 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  33.81 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  30.66 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  27.92 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  28.68 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  27.67 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  26.86 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  29.58 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  31.9 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  30 
 
 		 329 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  31.16 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  23.93 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  26.21 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  25.55 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  24.26 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  22.7 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3707  hypothetical protein  29.2 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  25.42 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4518  hypothetical protein  22.7 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  27.12 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3908  hypothetical protein  27.11 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  24.79 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  24.65 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  26.32 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  38.6 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  24.14 
 
 		 170 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>