37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2497 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  67.03 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  57.73 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  58.08 
 
 		 189 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  46.45 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  36.09 
 
 		 163 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  38.78 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  35.66 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  35.57 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  33.52 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  34.69 
 
 		 163 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  36.11 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  34.51 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  34.51 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  34.75 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  31.98 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  35.17 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  34.75 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  34.75 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  34.75 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  33.57 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  31.76 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  34.03 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  31.94 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  33.1 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  30.72 
 
 		 438 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  29.28 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  32.86 
 
 		 326 aa  71.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  29.03 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.68 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  27.4 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  29.31 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  26.92 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  34.81 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  33 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>