44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2253 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  100 
 
 
170 aa  347  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  87.65 
 
 
169 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  87.06 
 
 
169 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  74.55 
 
 
178 aa  253  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  74.55 
 
 
178 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  72.62 
 
 
181 aa  247  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  73.05 
 
 
180 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  73.05 
 
 
180 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  79.71 
 
 
179 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  75.91 
 
 
169 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  66.46 
 
 
175 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  65.49 
 
 
189 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  65.94 
 
 
173 aa  196  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  64.49 
 
 
175 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  52.08 
 
 
167 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  40.8 
 
 
174 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  44.44 
 
 
163 aa  130  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  41.18 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  44.85 
 
 
161 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  40.74 
 
 
164 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  37.93 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  35.66 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  32.34 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  35.82 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  32.39 
 
 
314 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  34.18 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  34.27 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  30.97 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  30.59 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  33.33 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  31.65 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  34.81 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  28.28 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  28.79 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  30 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  29.32 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  34.4 
 
 
227 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  26.15 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  26.35 
 
 
157 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  30.84 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  25.19 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  25 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  32.04 
 
 
220 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>