40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0524 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  49.4 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  50.64 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  51.32 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  48.61 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  47.45 
 
 		 326 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  43.37 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  44.03 
 
 		 438 aa  140  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  41.89 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  41.18 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  43.24 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  41.72 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  43.26 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  40 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  42.47 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  40.41 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  40.41 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  43.97 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  45.07 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  42.34 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  43.97 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  43.45 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  42.96 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.86 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  33.33 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  32.89 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  37.31 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  32.05 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  27.5 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.5 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  29.38 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  26.28 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  30.06 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  27.66 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  33.03 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  29.46 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  24.39 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>