45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4573 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  100 
 
 		 175 aa  349  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  70.8 
 
 		 169 aa  213  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  65.45 
 
 		 180 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  65.45 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  66.9 
 
 		 189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  70.5 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  63.41 
 
 		 178 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  63.64 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  63.41 
 
 		 178 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  72.79 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  70.07 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  67.39 
 
 		 169 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  67.39 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  64.49 
 
 		 170 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  53.47 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  46.72 
 
 		 163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  42.05 
 
 		 174 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  43.38 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  42.54 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  42.38 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  40.74 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  35.23 
 
 		 192 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  33.82 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  36.6 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  33.58 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  33.13 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  32.92 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  33.92 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  35.23 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  29.86 
 
 		 438 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  74.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  37.31 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.66 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  32.84 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  28.36 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  29.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  30.08 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  29.76 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  32.28 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  25.95 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  27.48 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  28.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  28.37 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>