35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2432 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  77.86 
 
 		 155 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  68.67 
 
 		 157 aa  220  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  60.9 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  66.67 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  52.53 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  56.82 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  34.18 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  31.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  32.73 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  30.18 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  32.35 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  29.59 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  30.6 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  30.43 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  29.93 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  27.91 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  29.93 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  31.39 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  28.36 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  31.87 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  28.99 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  28.99 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  30.66 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  29.85 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  30 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  26.11 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  28.9 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  24.86 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2468  hypothetical protein  27.88 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  24.85 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  25.36 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  26.72 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>