36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1603 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  60 
 
 
156 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  52.56 
 
 
157 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  52.53 
 
 
156 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  55.19 
 
 
157 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  54.26 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  53.85 
 
 
155 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  34.62 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  33.54 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  30.82 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  27.49 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  25.95 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  29.77 
 
 
178 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  30.71 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  30.71 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  29.77 
 
 
179 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  27.48 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  29.17 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  29.77 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  27.7 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  29.01 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  25.95 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  25.19 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  25.19 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  25.19 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  25.95 
 
 
173 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  26.09 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  30.47 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  28.68 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  27.52 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2852  hypothetical protein  32.03 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  24.58 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  25 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  25.71 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  28.71 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>