44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2256 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  100 
 
 		 169 aa  350  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  76.76 
 
 		 189 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  69.94 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  68.71 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  75.91 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  70.44 
 
 		 170 aa  226  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  74.45 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  74.45 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  74.45 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  73.53 
 
 		 173 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  70.95 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  70.95 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  75.74 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  70.8 
 
 		 175 aa  213  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  55.48 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  50.36 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  43.2 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  43.75 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  42.22 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  42.96 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  40 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  38.24 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  32.41 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  35.77 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  31.91 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  33.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  36.22 
 
 		 326 aa  77.8  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  31.94 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  32.6 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.01 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.04 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  34.53 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  30.54 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  31.58 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  29.66 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  29.52 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  27.48 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  32.79 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  26.52 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  31.73 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  25.93 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  26.44 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>