34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1743 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  51.3 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  58.46 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  48.39 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  52.38 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  53.85 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  32.87 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  34.62 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  31.85 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  31.73 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  34.62 
 
 		 189 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  31.78 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  31.78 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  30.84 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  29.91 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  29.91 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  32.69 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  30.54 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  29.86 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  28.04 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  28.04 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  32.73 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  30.97 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  30.61 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  27.59 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  30.15 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  27.45 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  29.75 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  24.87 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4518  hypothetical protein  26.47 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>