45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3509 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  98.89 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  93.92 
 
 		 181 aa  340  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  91.11 
 
 		 178 aa  333  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  91.11 
 
 		 178 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  85.64 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  79.05 
 
 		 169 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  73.05 
 
 		 170 aa  244  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  79.05 
 
 		 169 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  73.1 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  74.45 
 
 		 169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  72.66 
 
 		 175 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  66.45 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  67.65 
 
 		 173 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  50 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  45.99 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  40.91 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  44.12 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  43.7 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  40.44 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  36.03 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  34.56 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  33.58 
 
 		 326 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  33.57 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.71 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  31.96 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  31.36 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  30.56 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  34.51 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  33.15 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  34.04 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  31.79 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  34.51 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  31.51 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  28.79 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  29.71 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  27.91 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  29.32 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  31.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  29.77 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  25.74 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  28.93 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  24.43 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 329 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  24.14 
 
 		 220 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>