34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0132 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  50.29 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  42.42 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  39.87 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  39.87 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3707  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  34.4 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  27.91 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  29.93 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  28.93 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  32.23 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  32.23 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  28.8 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  31.45 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  25.62 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  28.93 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  28.93 
 
 		 180 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  28.93 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  37.14 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  32.31 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  25.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  30.95 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  25.62 
 
 		 174 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  27.59 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  28.19 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  29.55 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  27.56 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  24.58 
 
 		 155 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  33 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  26.32 
 
 		 158 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  33.03 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  23.97 
 
 		 156 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>