38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2997 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  71.64 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  58.6 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  64.89 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  59.87 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  56.15 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  51.3 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  31.48 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  31.45 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.22 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  29.59 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  27.07 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  25 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  28.57 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  26.35 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  25.74 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  25.74 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  25.74 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  25.74 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  28.46 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  25.62 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  25.93 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  25.61 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  27.27 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  27.15 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  22.6 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  28.05 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  27.16 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2852  hypothetical protein  32.31 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  29.32 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  25 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  25 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2468  hypothetical protein  27.68 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  29.69 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  24.68 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  24.64 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>