43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3747 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  72.06 
 
 		 167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  48.28 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  50.36 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  44.44 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  46.72 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  46.72 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  49.26 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  46.72 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  43.45 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  44.24 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  44.31 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  45.59 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  44.31 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  45.59 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  43.64 
 
 		 178 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  45.26 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  38.92 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  43.57 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  38.1 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  39.86 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  37.32 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  39.1 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  34.33 
 
 		 438 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  34.69 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  38.13 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.97 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  33.11 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  34.01 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  31.69 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  27.44 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  28.19 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  28.66 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  32.65 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  29.76 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  29.27 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  26.32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  23.45 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  29.37 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  28.92 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>