46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2630 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  94.48 
 
 
180 aa  343  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  93.92 
 
 
180 aa  340  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  92.27 
 
 
178 aa  339  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  92.27 
 
 
178 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  85.08 
 
 
179 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  79.19 
 
 
169 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  79.19 
 
 
169 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  72.62 
 
 
170 aa  247  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  75.91 
 
 
169 aa  227  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  75 
 
 
189 aa  225  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  67.74 
 
 
175 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  69.57 
 
 
175 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  66.43 
 
 
173 aa  203  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  50.69 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  40.91 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  45.26 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  42.65 
 
 
163 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  42.96 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  41.18 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  36.11 
 
 
175 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  34.33 
 
 
326 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  34.15 
 
 
170 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  31.06 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  33.56 
 
 
438 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.53 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  31.94 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  34.51 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  31.03 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  32.34 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  38.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  32.56 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  31.08 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  31.13 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  28.79 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  27.69 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  28.99 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  28.14 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  29.77 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  25.74 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  28.93 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  24.43 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  28.11 
 
 
198 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  30.6 
 
 
329 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  30.69 
 
 
220 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>