20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0890 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  64.05 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  58.38 
 
 		 203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  42.42 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  38.17 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3707  hypothetical protein  29.17 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  27.97 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  29.61 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  29.61 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  28.37 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  28.11 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  25.95 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  25.42 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  29.93 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  27.66 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  29.19 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  26.92 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>