22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1074 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  100 
 
 		 183 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  47.2 
 
 		 329 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3707  hypothetical protein  49.35 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  36.89 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  29.66 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  30.87 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  28.19 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  26.63 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  31.76 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  29.31 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  32.76 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  37.5 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  23.78 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  27.81 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4518  hypothetical protein  23.78 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  29.13 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  25.41 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1467  hypothetical protein  25.75 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  30.77 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>