27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3706 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  461  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  50.29 
 
 
227 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  38.17 
 
 
198 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  40.24 
 
 
209 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  37.8 
 
 
203 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  32.12 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  27.7 
 
 
329 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  32.79 
 
 
169 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  28.46 
 
 
157 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  27.03 
 
 
175 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  26.59 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  29.38 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  26.54 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  33.96 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  30.25 
 
 
162 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  32.04 
 
 
170 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  35.71 
 
 
314 aa  45.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  30 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  30 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  30.39 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  30.39 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  32.04 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  24.14 
 
 
180 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  23.76 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  31.25 
 
 
161 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>