37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2544 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  100 
 
 		 170 aa  353  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  48.48 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  51.45 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  52.17 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  51.05 
 
 		 326 aa  161  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  44.12 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  45.39 
 
 		 438 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  43.75 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  37.76 
 
 		 314 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  39.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  34.16 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  34.16 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  38.06 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  35.82 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  39.13 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  34.94 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  38.24 
 
 		 189 aa  87.8  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  34.15 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  33.82 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  34.56 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  38.24 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  34.56 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  33.82 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  32.34 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  32.35 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  32.35 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  33.78 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  25.67 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  31.61 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  29.07 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  29.09 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  27.27 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  24.55 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 183 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  24.65 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  25.17 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  24.14 
 
 		 158 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>