43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0746 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  100 
 
 		 164 aa  336  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  65.85 
 
 		 163 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  48.55 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  47.73 
 
 		 326 aa  138  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  48.63 
 
 		 438 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  41.21 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  40.49 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  43.31 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  42.68 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  40.44 
 
 		 314 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  40.12 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  39.86 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  44.44 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  43.7 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  43.7 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  43.7 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  42.96 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  37.06 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  40.67 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  40.67 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  42.22 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  40.41 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  40.12 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  41.43 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  34.55 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  41.13 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  39.51 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  32.97 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  34.94 
 
 		 185 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  37.5 
 
 		 192 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  36.91 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  32.14 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.2 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  35.04 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  31.9 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  32.31 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  29.7 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  30.47 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0073  hypothetical protein  30.13 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  32.04 
 
 		 220 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  25.66 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  25.57 
 
 		 174 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>