61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1472 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  40.84 
 
 		 438 aa  258  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  41.85 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  42.22 
 
 		 163 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  41.18 
 
 		 161 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  40.44 
 
 		 164 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  40.43 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  37.76 
 
 		 170 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  35.46 
 
 		 166 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  39.6 
 
 		 145 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  34.9 
 
 		 174 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  34.31 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  32.39 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  31.69 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  30.56 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  30.56 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  33.86 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  34.78 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  34.62 
 
 		 163 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  32.17 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  32.17 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  39.81 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  35.61 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  30.77 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  31.37 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  30.83 
 
 		 179 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  36.36 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  42.31 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  40.38 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  38.21 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  30.39 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  38.1 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  35.96 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  39.45 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  32.84 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  36.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  26.56 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  34 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  27.54 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  27.86 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  28.99 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  29.79 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  27.4 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  28.68 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  27.05 
 
 		 151 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  30.67 
 
 		 169 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  27.13 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  35.62 
 
 		 138 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  25.24 
 
 		 145 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  37.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  24.85 
 
 		 464 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  26.24 
 
 		 200 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>