38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1450 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  100 
 
 		 166 aa  347  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  59.6 
 
 		 175 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  48.48 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  44.59 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  45.52 
 
 		 326 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  44.7 
 
 		 438 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  41.03 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  44.37 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  37.25 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  36.73 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  35.46 
 
 		 314 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  31.06 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  34.33 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  32.12 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  36.17 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  35.82 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  33.58 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  35.88 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  33.33 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  31.36 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  31.36 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  32.59 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  32.37 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  30.97 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  33.33 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  33.33 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  31.65 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  33.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  31.43 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  26.99 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  27.71 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  23.6 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  23.93 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  22.4 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.52 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  21.43 
 
 		 174 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>