35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2117 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2117  putative cytochrome P460  100 
 
 		 175 aa  357  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.890986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1450  putative cytochrome P460  53.71 
 
 		 166 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.016408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2544  putative cytochrome p460  52.17 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  52.17 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  46.67 
 
 		 326 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  41.1 
 
 		 438 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  39.71 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  39.58 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  42.68 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  40.43 
 
 		 314 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  37.84 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  40.44 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  36.11 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  34.44 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  34.5 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  40 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  34.5 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  37.68 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  35.62 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  34.1 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  40.15 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  34.1 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  40.15 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  36.05 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  37.32 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2497  putative cytochrome P460  31.55 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  33.85 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8601  putative cytochrome P460  28.89 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.495848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1367  putative cytochrome P460  30.46 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  32.12 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  28.17 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  28.85 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  26.87 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  28.06 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>