41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2731 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1510  hypothetical protein  91.03 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.346276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  58.6 
 
 		 157 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2432  hypothetical protein  65.41 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91614e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1284  cytochrome c, putative  59.54 
 
 		 155 aa  173  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1743  hypothetical protein  50.32 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1603  hypothetical protein  56.49 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000079438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2394  cytochrome c'  35.67 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  30.43 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  32.52 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6163  putative cytochrome P460  31.82 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5266  hypothetical protein  31.06 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3445  hypothetical protein  30.3 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0520  putative cytochrome P460  32.19 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2630  hypothetical protein  28.79 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4009  hypothetical protein  28.79 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5143  hypothetical protein  28.79 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.963706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3509  hypothetical protein  28.79 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2253  cytochrome p460  28.79 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2256  putative cytochrome P460  30.66 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4573  putative cytochrome P460  31.47 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3746  cytochrome c'  31.01 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3841  putative cytochrome P460  30.56 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3066  cytochrome p460  28.79 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2940  cytochrome p460  28.79 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2626  cytochrome p460, putative  33.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4485  hypothetical protein  24.82 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4518  hypothetical protein  24.82 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3585  putative cytochrome P460  34.29 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0746  cytochrome p460, putative  36.36 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3747  putative cytochrome P460  29.76 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2468  hypothetical protein  28.12 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1537  putative cytochrome P460  24.43 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638802  normal  0.201199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2696  hypothetical protein  26.14 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  37.33 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  25.54 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0524  cytochrome P460  30.06 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3511  putative cytochrome P460  26.09 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  23.97 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2201  putative cytochrome P460  28.78 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200069  normal  0.947235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>