122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2182 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2182  outer membrane protein, porin  100 
 
 		 352 aa  712    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000999  outer membrane protein C precursor  58.15 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.89 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  27.09 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  28.01 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  29.71 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  27.02 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  28.9 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  29.35 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  29.35 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  29.35 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  29.35 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  30.55 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  26.63 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  27.25 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  27.05 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0572  outer membrane protein, putative porin  23.68 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  26.3 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  23.66 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  29.93 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  28.36 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  28.36 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  28.36 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  30.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  30.83 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  28.82 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  30.15 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  28.14 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  28.99 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  29.24 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  27.24 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  27.24 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  27.24 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  27.24 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  25.97 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  26.44 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  28.42 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  29.17 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003962  outer membrane protein OmpT  27.85 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  26.56 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  25.67 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  28.1 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  26.49 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  27.3 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  33.61 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  28.57 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  25.99 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  27.83 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  26.14 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  26.11 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  25.99 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  27.36 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  27.36 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  27.36 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  26.12 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  24.06 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  27.36 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  27.04 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  21.47 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  26.85 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  26.85 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  26.85 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  26.85 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  26.85 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  27.16 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  31.21 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  27.24 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  25.68 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  27.27 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  27.24 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  27.24 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  25.68 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  27.04 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  29.43 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  25.39 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  27.21 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  24 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  29.17 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  23.42 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  23.42 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  23.42 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  23.76 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  23.3 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  26.96 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  27.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  29.17 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  27.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  27.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  27.08 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  26.3 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  27.57 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  27.25 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  26.09 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  27.08 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  25 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  22.76 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  24.81 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  24.81 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  24.81 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  24.81 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>