52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000999 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000999  outer membrane protein C precursor  100 
 
 		 351 aa  713    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2182  outer membrane protein, porin  58.41 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  23.97 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  25.61 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  26.42 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  26.18 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  28.15 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  27.78 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  27.78 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  27.78 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  26.29 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  28.21 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  27.41 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  32.5 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  32.5 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  30.13 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  32.5 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  30.13 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  29.3 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  26.86 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  26.92 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  26.92 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  26.92 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  26.92 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  24.15 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  25.95 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  29.61 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  26.06 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  23.71 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  28.57 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  25.64 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  28 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1665  porin Gram-negative type  34.17 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000257252  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0572  outer membrane protein, putative porin  23.87 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  25.64 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  34.15 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  30.72 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  34.15 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  30.72 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  34.15 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  22.32 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  22.32 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  28.1 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  22.32 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  28.1 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  28.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  22.03 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  25.65 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  25.61 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  23.08 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  23.31 
 
 		 364 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>